本学会では，研究成果の発表，情報交換の場として，学術研究誌「医療バランスト・スコアカード研究」（ISSN 1349-6662）を発行しています。第1巻（2004年）から第7巻（2010年）までは毎年１号ずつ，第8巻（2011年）以降は毎年２号（第1号，第2号）ずつ発行しています。
各巻第1号は学術総会特集号であり，第2号は一般投稿論文号です。
＜J-STAGE移行による投稿規定改定20201017＞
本学会誌は2019年度より電子ジャーナル化し，PDF形式で学会ホームページに学会員用として掲載することとしました。2020年度には文部科学省所管の独立行政法人科学技術振興機構が運営する電子ジャーナルの無料公開システムであるJ-STAGEに搭載することを決定しました。学会誌の全内容は会員用としてホームページ掲載を継続し，非公開希望論文類を除外するなど学会誌編集員会で選定した論文類をJ-STAGEに搭載することになり，実態にあわせて必要な投稿規定の改定を行いました。（2020年10月17日）
なお，既発刊学会誌（印刷形式）についてのJ-STAGEへの遡及的移行についても決定され順次編集員会を経て行うこととなりました。
J-STAGEでは、発行から1年間は会員のみ閲覧可能です。
